LABORATORIO PALERMO: MICROBIOTA INTESTINALE

Parametri di base ovvero l’indice di biodiversità (alpha-diversity) e l’eventuale grado di disbiosi dell’ecosistema intestinale. Di norma, un microbiota sano è caratterizzato da un alto livello di diversificazione tassonomica

•    Analisi descrittiva dell’abbondanza relativa delle famiglie batteriche presenti nel campione

•    Analisi delle principali classi funzionali per determinare il grado di efficienza metabolica ovvero la capacità del microbiota di produrre composti rilevanti per la salute umana. Tra le attività e i metaboliti principalmente valutati troviamo:

o    Attività proteolitica che consente di degradare le proteine animali; una sua iper-espressione compromette il metabolismo energetico attraverso la produzione di composti bioattivi

o    Attività mucolitica importante per garantire il rinnovamento dello strato mucosale ma che, se eccessivamente stimolata, può portare anche al danneggiamento della mucosa stessa.

o    Acidi grassi a catena corta o SCFAs (propionato, butirrato, acetato), importanti per il corretto funzionamento del sistema immunitario, del metabolismo energetico e per l’integrità della barriera intestinale

o    Lattato per il controllo del pH del lume intestinale

o    Acido solfidrico in quanto una sua eccessiva produzione promuove l’infiammazione e la permeabilità intestinale con conseguente diffusione batterica nel circolo sistemico

o    Lipopolisaccaride batterico, un’endotossina importante per la giusta stimolazione del sistema immunitario ma che se prodotta in quantità elevate può portare a diverse patologie anche autoimmuni

•    Valutazione della presenza di gruppi batteri potenzialmente patogeni (Clostridium perfringens, Salmonella, Clostridium difficile ecc.). Anche se presenti in bassissime concentrazioni infatti possono, proliferando in poco tempo, dar luogo a diverse patologie o stati infettivi anche clinicamente rilevanti

•    Analisi delle funzioni fisiologiche espresse in “indici” calcolati in base all’abbondanza relativa delle specie coinvolte in quella funzione. Nel dettaglio:

o    Immunomodulazione: indica la capacità del microbiota di sostenere correttamente il sistema immunitario in base all’espressione di batteri immunomodulanti

o    Regolazione delle attività cognitive ed emotive: considerando l’ormai comprovata esistenza dell’asse intestino-cervello, è valutata la presenza di batteri in grado di produrre metaboliti in grado di regolare lo stato di stress, ansia, depressione come ad esempio la serotonina

o    Capacità di resistenza ai patogeni: detto anche effetto barriera, esprime il grado con cui il microbiota è in grado di reprimere o ostacolare la colonizzazione e la proliferazione di microorganismi potenzialmente dannosi

o    Potenzialità nel favorire lo sviluppo di patologie infiammatorie intestinali, metaboliche, cardiovascolari o disordini legati all’invecchiamento. Numerosi studi hanno finora dimostrato come una disbiosi batterica sia coinvolta nell’instaurarsi di questi quadri clinici. Conoscere l’eventuale concentrazione dei ceppi predisponenti può essere utile anche in fase di prevenzione

o    Condizionamento della permeabilità intestinale. Come anticipato, alcuni batteri attraverso la produzione di specifici metaboliti portano benefici all’epitelio intestinale, altri invece ne minano l’integrità e quindi la corretta funzionalità con possibili conseguenze a livello sistemico

Il campione viene poi analizzato attraverso tecniche all’avanguardia di sequenziamento massivo (Next Generation Sequencing)  che permettono, attraverso l’elaborazione bioinformatica e statistica dei dati, l’identificazione di tutta la componente batterica presente. Infine, sulla base delle abbondanze relative ottenute si restituisce un quadro completo e fruibile di come l’ecosistema microbico possa impattare la fisiologia dell’ospite applicando un metodo di interpretazione funzionale brevettato. Il referto è di norma disponibile entro 30/40 giorni.

In base ai risultati ottenuti, rigorosamente dietro consulto di un professionista di riferimento, sarà infatti possibile, se necessario, adottare le giuste strategie correttive basate principalmente sulla sana alimentazione e sull’eventuale integrazione con probiotici e/o prebiotici in base alle singole esigenze, anche in un’ottica di prevenzione.